Primers de PCR para amplificar genes do rRNA 16S de cianobactérias

Desenvolvemos e testamos um conjunto de primers oligonucleotídicos para a ampliação específica de segmentos do gene do rRNA 16S de cianobactérias e plastídeos por PCR. Os produtos de PCR foram recuperados de todas as culturas de cianobactérias e diatomáceas que foram verificadas, mas não de outras bactérias e arquéias. Segmentos gênicos recuperados seletivamente de cianobactérias e diatomáceas em culturas unialgal, mas não axênicas, e de cianobiontes em líquenes puderam ser sequenciados diretamente. No contexto de bancos de dados de sequência em crescimento, este procedimento permite identificação rápida e filogeneticamente significativa sem culturas puras ou clonagem molecular. Demonstramos o uso desta PCR específica em combinação com eletroforese em gel com gradiente desnaturalizante para examinar a diversidade de microorganismos fototróficos oxigenéticos em culturas, líquenes e comunidades microbianas complexas.