A análise da sequência de DNA sugere que a expressão dos genes de flagelo e quimiotaxia em Escherichia coli e Salmonella typhimurium é controlada por um fator sigma alternativo.

A biossíntese de flagelos bacterianos envolve a expressão coordenada de 30 ou mais genes em vários operons separados. Recentemente, mostramos que em Bacillus subtilis, o fator sigma 28 é essencial para a síntese de flagelos, sugerindo que a transcrição desses genes está diretamente sob o controle desse fator sigma alternativo. Em bactérias entéricas, os genes estruturais para flagelos, quimiotaxia e operons de motilidade parecem estar sob controle coordenado, entretanto, a natureza dos fatores regulatórios não foi determinada. A análise de sequência de muitos desses genes falhou em revelar sequências promotoras plausíveis para a polimerase RNA bacteriana predominante, e vários desses genes não são transcritos efetivamente in vitro pela polimerase RNA sigma 70 de Escherichia coli. No entanto, todos os operons de flagelo, quimiotaxia e motilidade sequenciados das bactérias entéricas são precedidos por sequências de DNA altamente homólogas aos promotores sigma 28 de B. subtilis. Propomos que um fator sigma alternativo controla a expressão do regulon de flagelos tanto em B. subtilis quanto nas bactérias entéricas.