Localizando locais de ligação de fatores de transcrição em mamíferos: Uma revisão de técnicas computacionais e experimentais

Campos como genômica e biologia de sistemas são construídos sobre o sinergismo entre técnicas computacionais e experimentais. Esse tipo de sinergismo é especialmente importante para alcançar objetivos como identificar todos os locais funcionais de ligação de fatores de transcrição em genomas de vertebrados. A detecção precisa desses elementos é um pré-requisito para decifrar as complexas redes regulatórias que direcionam padrões específicos de expressão gênica em tecidos e linhagens. Esta revisão resume abordagens para a identificação in silico, in vitro e in vivo de locais de ligação de fatores de transcrição. Uma variedade de técnicas úteis para análises localizadas e de alto rendimento são discutidas aqui, com ênfase nos aspectos de geração e verificação de dados.