O aborto em gado implica em substancial perda econômica, e a identificação rápida de patógenos abortivos é crítica para uma resposta rápida na fazenda e redução do risco de exposição humana. Em 2024, duas vacas Holstein de uma pequena fazenda na Mongólia Interior abortaram em estreita sucessão sem uma causa óbvia. Amostras de swabs vulvares de ambas as vacas, uma amostra de placenta e sangue total de um feto abortado foram coletadas. Sequenciamento metagenômico shotgun foi realizado, seguido pela remoção de leituras do hospedeiro, perfilamento taxonômico com Kraken2, montagem de novo de leituras alinhadas a Brucella, e comparação do genoma completo. Testes sorológicos, esfregaços corados por Gram e ensaios qPCR específicos para o gênero e espécie Brucella foram utilizados como verificação ortogonal. Determinantes de resistência e virulência putativos foram triados contra CARD e VFDB. Leituras de Brucella foram detectadas em todas as amostras, com a maior abundância relativa na amostra de 138-placenta (96%). Ensaios qPCR detectaram DNA de Brucella e sinais específicos de B. abortus em todas as quatro amostras. Um genoma draft de Brucella foi montado a partir da amostra de 138-placenta e foi colocado filogeneticamente dentro de B. abortus, mostrando relação com linhagens chinesas que circularam anteriormente. As vacas 138 e 198 foram positivas no RBT com títulos SAT de 1:100 (++). Nenhum gene de resistência adquirida de Brucella foi identificado no CARD. Dentro de 72 horas após o recebimento das amostras, B. abortus foi reportado à fazenda e autoridades locais e medidas de biosegurança de emergência foram implementadas. Esta investigação de campo mostra que o sequenciamento metagenômico, quando combinado com sorologia convencional, microscopia e qPCR direcionada, pode apoiar investigações etiológicas rápidas quando a cultura é atrasada, perigosa ou instalações de biossegurança de nível 3 não estão disponíveis.
Xue et al. (Sat,) estudaram esta questão.