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A radioterapia é uma das principais formas de tratamento anticâncer, mas a relação entre a radiosensibilidade das células cancerosas e suas características genômicas ainda não está bem definida. Aqui, relatamos o desenvolvimento de uma plataforma de alto rendimento para medir a sobrevivência à radiação in vitro e sua validação em comparação com a análise convencional de sobrevivência clonogênica à radiação. Combinamos resultados deste ensaio de alto rendimento com parâmetros genômicos em linhas celulares de carcinoma de pulmão de células escamosas, que é tratado de forma padrão pela radioterapia, para identificar parâmetros que preveem a sensibilidade à radiação. Mostramos que a ativação de NFE2L2, um evento frequente nos cânceres escamosos de pulmão, confere resistência à radiação. Um rastreamento baseado em expressão in silico indicou inibidores de fosfoinositídeo 3-quinase (PI3K) como antagonistas de NFE2L2. Mostramos que o inibidor seletivo de PI3K, NVP-BKM120, reduziu os níveis de proteína NRF2 e sensibilizou células mutantes de NFE2L2 ou KEAP1 à radiação. Em seguida, combinamos resultados deste ensaio de alto rendimento com uma análise de enriquecimento de conjunto de genes de amostra única de dados de expressão gênica. A análise resultante identificou vias implicadas na sobrevivência celular, estresse genotóxico, desintoxicação e imunidade inata e adaptativa como correlatos-chave da sensibilidade à radiação. Os métodos integrativos e de alto rendimento mostrados aqui para o perfilamento em larga escala da sobrevivência à radiação e características genômicas de linhas celulares derivadas de tumores sólidos devem facilitar a radiogenômica tumoral e a descoberta de sensibilizadores e agentes protetores seletivos de genótipo à radiação.
Abazeed et al. (Mon,) estudaram essa questão.