Detecção de baixos números de células bacterianas em solos e sedimentos por reação em cadeia da polimerase

A reação em cadeia da polimerase foi utilizada para amplificar o baixo número de cópias de dois fragmentos do gene ribossômico 16S a partir de extratos de solo e sedimento. O DNA total para a reação em cadeia da polimerase foi extraído de 1 g de amostras semeadas ou não semeadas por um método rápido de congelamento e descongelamento. Fragmentos de DNA amplificados podem ser detectados em frações de DNA isoladas de solo semeado contendo menos de 3 células de Escherichia coli e de sedimentos semeados contendo menos de 10 células. Esta pesquisa demonstrou que a combinação da reação em cadeia da polimerase com a extração direta de DNA melhora a sensibilidade em 1 e 2 ordens de magnitude para sedimentos e solos, respectivamente. Esta técnica poderia se tornar uma ferramenta poderosa para estudos de ecologia genética.