Populações Distintas, mas Relacionadas, de Variantes do Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo 1 em Secreções Genitais e Sangue

Para que uma vacina contra o HIV seja eficaz, será essencial que proteja contra as variantes do vírus às quais os indivíduos estão mais frequentemente expostos. O HIV-1 é predominantemente um vírus adquirido sexualmente; assim, variantes em secreções genitais são um reservatório potencialmente importante de vírus que são transmitidos. Como não há dados disponíveis sobre variantes na mucosa genital, analisamos essa população de provírus e a comparamos com os provírus no sangue de indivíduos cronicamente infectados com HIV-1. Uma grande diferença genética entre variantes dentro de um paciente foram inserções, que aparentemente foram criadas pela duplicação de sequências adjacentes, resultando na aquisição de novos locais de glicolação potenciais em V1 e V2. Comparações de variantes mucosas e de PBMC sugerem que esses tecidos abrigam populações distintas, mas relacionadas de variantes do HIV-1. Em dois de três pacientes, as variantes mucosas estavam mais estreitamente relacionadas a um genótipo variante menor no sangue. Em um terceiro indivíduo, os vírus em ambos os tecidos eram surpreendentemente homogêneos, mas a maioria das variantes no colo do útero codificou uma sequência V1 com um padrão de glicolação previsto semelhante a uma variante menor no sangue. Os padrões de sequência V3 dos isolados mucosos indicam que podem ser predominantemente vírus tropicos de macrófagos.