Detecção Genética Precisa de Transmissões do Vírus da Hepatite C em Ambientes de Surto

A hepatite C é um grande problema de saúde pública nos Estados Unidos e em todo o mundo. Surto de infecções por vírus da hepatite C (HCV) estão associados a práticas de injeção inseguras, desvio de drogas e outras exposições ao sangue, sendo difíceis de detectar e investigar. Aqui, desenvolvemos e validamos uma abordagem simples para a detecção molecular de transmissões de HCV em ambientes de surto. Obtivemos sequências da região hipervariável 1 (HVR1) do HCV, usando a técnica de diluição em limite de ponto final (EPLD), de 127 casos envolvidos em 32 surtos de HCV definidos epidemiologicamente e 193 indivíduos com linhagens de HCV não relacionadas. Comparamos vários tipos de distâncias genéticas e calculamos um limite, usando distâncias de Hamming mínimas, que identifica agrupamentos de transmissão em todos os surtos testados com 100% de precisão. A abordagem também foi validada em sequências obtidas usando sequenciamento de nova geração de linhagens de HCV recuperadas de 239 indivíduos, e os achados mostraram a mesma precisão que a obtida com EPLD. Em média, a diversidade de nucleotídeos da população intra-hospedeiro foi 6,2 vezes maior no caso fonte do que em qualquer caso incidente, permitindo a detecção correta da direção de transmissão em 8 surtos para os quais os casos fonte eram conhecidos. Uma abordagem simples e precisa baseada em distâncias desenvolvida aqui para detectar transmissões de HCV torna a investigação molecular de surtos mais eficiente, melhorando assim a capacidade de saúde pública para o controle rápido e eficaz da hepatite C.