RNA fluorogênico no infravermelho próximo para imagem e sensoriamento in vivo

Aptâmeros de RNA fluorogênico têm várias aplicações, incluindo o uso como etiquetas fluorescentes para imagem do tráfego de RNA e como indicadores de sensores baseados em RNA que exibem fluorescência ao se ligarem a fluoróforos pequenos em células vivas. Os complexos atuais de RNA fluorogênico:fluoróforo geralmente emitem fluorescência visível. No entanto, é desafiador desenvolver RNA fluorogênico com fluorescência no infravermelho próximo (NIR) para estudos de imagem e sensoriamento in vivo. Para resolver esse problema, identificamos e modulamos fluoróforos semelhantes a proteínas fluorescentes vermelhas para se ligarem ao Squash, um RNA fluorogênico altamente estruturado. Um desses fluoróforos, DFQL-1T, exibe fluorescência NIR fotostável quando ligado ao Squash, permitindo a visualização de RNA em células de mamíferos vivos e em camundongos. Com os complexos Squash:DFQL-1T, geramos sensores baseados em RNA para detectar RNAs não codificadores e alvos de pequenas moléculas em células de mamíferos vivos e em camundongos. Esses estudos revelam um complexo de RNA fluorogênico:fluoróforo que pode ser prontamente desenvolvido em etiquetas de RNA fluorescentes NIR para imagem e sensoriamento in vivo. A maioria das abordagens de RNA fluorogênico disponíveis emite fluorescência visível, e há uma necessidade de ferramentas que funcionem em comprimentos de onda mais longos. Aqui, os autores identificam e modulam fluoróforos semelhantes a proteínas fluorescentes vermelhas para se ligarem ao RNA fluorogênico Squash, obtendo assim ferramentas baseadas em RNA fluorogênico no infravermelho próximo.