ConSurf 2005：进化保守性评分在蛋白质结构上的投影

对于维持蛋白质的三维结构和/或其功能（例如催化活性、结合配体、DNA或其他蛋白质）非常重要的关键氨基酸位点，通常受到强大的进化约束。因此，残基的生物学重要性通常与其在蛋白质家族中的进化保守程度相关。ConSurf（http://consurf.tau.ac.il/）是一个基于网络的工具，可以自动计算进化保守性评分，并通过用户友好的界面将其映射到蛋白质结构上。蛋白质中结构和功能重要的区域通常呈现出空间上相互接近的进化保守的残基斑块。我们在此介绍ConSurf的3.0版本。这个新版本包括了一种经验贝叶斯方法用于评分保守性，比之前版本中使用的最大似然法更为准确。现在计算中的各种附加步骤可以通过多个高级选项进行控制，从而进一步提高计算的准确性。此外，ConSurf 3.0版本还包括了对推断的氨基酸保守性评分的置信度度量。