DoeDat: Verbesserte Rückführung von crowdsourceden Probenannotationen

Die DoeDat-Plattform wurde 2018 vom Meise Botanic Garden ins Leben gerufen, um Labeldaten von abgebildeten Herbariumsproben zu erfassen, indem freiwillige Mitwirkende eingeladen wurden (Groom et al. 2018). Seitdem hat sie die Datenerfassung von Proben anderer naturhistorischer Sammlungen erleichtert (Helminger et al. 2020, Mitrache et al. 2023) sowie digitalisierte Inhalte aus verschiedenen anderen Disziplinen, wie historische Fotografien, Poster und Postkarten. Freiwillige können handschriftliche und / oder getypte Texte einfach transkribieren, interpretieren jedoch oft auch die spärlichen und verstreuten Informationen auf dem Bild, einschließlich des Versuchs, den ursprünglichen Standort georeferenziert zu bestimmen. Stand April 2024 wurden fast 650.000 Aufgaben abgeschlossen, von denen mehr als 470.000 Herbariumsproben aus Meise waren. DoeDat unterstützt Fachstandards, einschließlich Darwin Core, und folgt den meisten der derzeit ausgearbeiteten MIDS (Minimum Information about a Digital Specimen) Richtlinien bezüglich der erfassten Daten für naturhistorische Proben. Allerdings müssen die Bilder für jedes Projekt in den Server-Speicher vorab geladen werden, und die erfassten Daten werden als eine oder mehrere CSV-Dateien pro Projekt exportiert. Diese Datendateien müssen dann noch verarbeitet werden, bevor sie in das lokale Managementsystem übernommen werden können (Engledow et al. 2023). Oft unterliegen die Daten auch zusätzlicher Qualitätskontrolle, bevor sie offen veröffentlicht werden. Dies kann dazu führen, dass die Pipeline vom Bild zu offen veröffentlichten Annotationen zeit- und arbeitsintensiv ist. Während die Biodiversitätsinfrastruktur immer mehr auf FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) offene Daten zusteuert, wird DoeDat sich entsprechend anpassen. Dazu gehören digitale Objekte, die einfach zu annotieren sind. Darüber hinaus standardisieren Bildserver, die IIIF (International Image Interoperability Framework) folgen, den Zugriff und die Portabilität von Medieninhalten erheblich und verändern drastisch die Art und Weise, wie mit Bildern umgegangen wird. Wir planen, die DoeDat-Plattform zu aktualisieren, um Bilder und alle erforderlichen Metadaten als IIIF-Mansifest zu laden, was den Prozess des Hinzufügens neuer Inhalte und der Verfolgung der Herkunft erheblich rationalisieren wird. Die Transkriptionen sollten für externe Systeme zugänglich sein, indem die aktualisierten Bildmanifeste geladen und als Annotationen veröffentlicht werden, wie zum Beispiel Nanopublikationen.