Aktuelle Einschränkungen bei der Vorhersage der mRNA-Translation mit Deep-Learning-Modellen

Das Design von Nukleotidsequenzen mit definierten Eigenschaften ist ein langanhaltendes Problem im Bioengineering. Eine wichtige Anwendung ist die Proteinexpression, sei es im Kontext der Forschung oder der Produktion von mRNA-Impfstoffen. Die Rate der Proteinsynthese hängt von der 5' untranslated region (5'UTR) der mRNAs ab, und kürzlich wurden Deep-Learning-Modelle vorgeschlagen, um die Translationsausgabe von mRNAs anhand der 5'UTR-Sequenz vorherzusagen. Gleichzeitig sind große Datensätze zur Translation endogener und Reporter-mRNA verfügbar geworden.