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Zusammenfassung Legionella pneumophila nutzt das Dot/Icm Typ IVB Sekretionssystem, um Hunderte von Effektorproteinen in eukaryotische Zellen zu liefern und so die intrazelluläre Replikation zu gewährleisten. Unser Verständnis der molekularen Funktionen dieses größten pathogenen Arsenal, das der bakteriellen Welt bekannt ist, bleibt unvollständig. Durch die Nutzung von Fortschritten in der 3D-Proteinstrukturvorhersage bieten wir eine umfassende strukturelle Analyse von 368 L. pneumophila-Effektoren, die ein globales Atlas der vorhergesagten funktionalen Domänen darstellt und in einer Datenbank zusammengefasst ist ( https://pathogens3d.org/legionella-pneumophila ). Unsere Analyse identifizierte 157 Arten verschiedener funktionaler Domänen in 287 Effektoren, einschließlich 159 Effektoren ohne vorherige funktionale Annotationen. Darüber hinaus identifizierten wir 35 einzigartige Domänen in 30 Effektor-Modellen, die keine Ähnlichkeit mit experimentell strukturell charakterisierten Proteinen aufweisen, und somit auf neuartige Funktionalitäten hinweisen. Mithilfe dieser Analyse zeigen wir die Aktivität von dreizehn Domänen, einschließlich drei einzigartiger Faltungen, die in L. pneumophila-Effektoren vorhergesagt werden, um Wachstumsdefekte im Modell-System Saccharomyces cerevisiae zu verursachen. Dies verdeutlicht eine aufkommende Strategie, Synergien zwischen Vorhersagen und gezielten experimentellen Ansätzen zu erkunden, um neuartige Effektoraktivitäten zu beleuchten, die an Infektionen beteiligt sind.
Patel et al. (Thu,) studied this question.