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Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) haben mehr als 200 häufige genetische Varianten identifiziert, die unabhängig mit dem Risiko für kolorektalen Krebs (CRC) assoziiert sind, aber die ursächlichen Varianten und Zielgene sind größtenteils unbekannt. Wir haben angestrebt, alle bekannten CRC-Risikoloci mithilfe von GWAS-Daten von 100.204 Fällen und 154.587 Kontrollen ostasiatischer und europäischer Herkunft präzise zu kartieren. Unsere schrittweisen bedingten Analysen ergaben 238 unabhängige Assoziationssignale des CRC-Risikos, von denen jedes mit einem Satz von glaubwürdigen ursächlichen Varianten (CCVs) verbunden war, wobei 28 Signale ein einzelnes CCV hatten. Unsere cis-eQTL/mQTL- und Kolozalisationanalysen unter Verwendung spezifischer Transkriptom- und Methylomdaten aus kolorektalen Geweben, getrennt von 1299 und 321 Individuen, zusammen mit funktionellen genomischen Untersuchungen, entdeckten 136 putative CRC-Risikogene, einschließlich 56 Gene, die zuvor nicht berichtet wurden. Analysen von Einzelzell-RNA-seq-Daten aus kolorektalen Geweben zeigten 17 putative CRC-Risikogene mit unterschiedlichen Expressionsmustern in spezifischen Zelltypen. Analysen von Ganzexomsequenzierungsdaten lieferten zusätzliche Unterstützung für mehrere Zielgene, die in dieser Studie als CRC-Risikogene identifiziert wurden. Anreicherungsanalysen der 136 Gene enthüllten Pfade, die zuvor nicht mit dem CRC-Risiko in Verbindung gebracht wurden. Unsere Studie erweiterte die Assoziationssignale für CRC erheblich und lieferte zusätzliche Einblicke in die biologischen Mechanismen, die der Entwicklung von CRC zugrunde liegen.
Chen et al. (2024) haben diese Frage untersucht.