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Die Verbindungsklasse der 4-Aminochinoline umfasst die wichtigen Antimalaria-Wirkstoffe amodiaquine und chloroquine. Trotz ihrer medizinischen Bedeutung ist der Wirkmechanismus dieser Verbindungen nur unzureichend verstanden. In einer früheren Studie beobachteten wir, dass diese Verbindungen sowie quinine und mefloquine fest an das Cocaine-bindende DNA-Aptamer binden. Hier untersuchen wir das Spektrum der von diesen Verbindungen gebundenen Nukleinsäurestrukturen weiter. Um einen breiten Bereich von Bindungsaffinitäten zu erfassen, verwendeten wir isotherme Titrationskalorimetrie zur Untersuchung hochaffiner Bindungen (nM bis zu mehreren zehn μM) und NMR-Spektroskopie zur Untersuchung schwacher Bindungen im Bereich von hunderten Mikromolar. Wir stellen fest, dass amodiaquine fest an alle untersuchten doppelsträngigen DNA-Strukturen bindet. Mefloquine bindet doppelsträngige DNA-Duplex-Moleküle fest und assoziiert schwach mit einem Three-Way-Junction-DNA-Konstrukt. Quinine und chloroquine binden Duplex-DNA nur schwach und binden an keines der untersuchten DNA-Konstrukte fest. Eine Simulation der freien Bindungsenergie dieser Liganden an das Dickerson-Drew-Dodekamer ergab eine hervorragende Übereinstimmung zwischen der simulierten und der experimentellen freien Energie. Diese Ergebnisse liefern neue Einblicke in die DNA-Bindung klinisch wichtiger Antimalaria-Verbindungen und könnten eine Rolle bei der zukünftigen Entwicklung neuer Antimalariamittel spielen.
Slavkovic et al. (Fri,) untersuchten diese Frage.