Beobachtungen aus einem Jahrzehnt der Oligonukleotid-Bioanalyse mittels LC-MS

Es besteht ein wachsender Bedarf an effizienter Bioanalyse von Oligonukleotid-Therapeutika. Diese breite Klasse von Molekülen stellt zahlreiche Herausforderungen im Vergleich zu traditionellen kleinen Molekülen dar. Methoden wie Liganden-Bindungsassays oder die Polymerase-Kettenreaktion können in vielen Fällen geeignet sein, jedoch bietet die Verbindung von Flüssigchromatographie mit Massenspektrometrie (LC-MS) oft die beste Balance zwischen Sensitivität und Selektivität. In den letzten zehn Jahren haben wir mit vielen solchen Molekülen gearbeitet und Erkenntnisse über Herausforderungen und Lösungen gewonnen. Hier präsentieren wir vier Fallstudien, die die Herausforderungen veranschaulichen, auf die wir gestoßen sind. Diese Probleme umfassen niedrige oder variable Analytrückgewinnung, schlechte Auflösung von verwandten Spezies, chromatographische Anomalien oder schwierige Sensitivität. Wir präsentieren eine Zusammenfassung von Überlegungen, basierend auf diesen Erfahrungen, um anderen, die in diesem Bereich arbeiten, zu helfen.