Zusammenfassung LB331: Integration mehrerer räumlicher Transkriptom- und Proteomtechnologien zur Erstellung eines Krebsatlas zur Untersuchung des Tumormikroumfelds

Die tiefgehende Einzelzell-Genomik hat einen monumentalen Sprung in unserem Verständnis und der kategorischen Analyse von Krebszellen und ihren einzigartigen molekularen Eigenschaften ermöglicht. Mit räumlichen Plattformen, die die Gewebearchitektur bewahren, bietet ein aufkommendes Verständnis komplexer Zellinteraktionen und lokaler Umwelteinflüsse neue Perspektiven für gezielte Therapien. Hier beschreiben wir einen umfassenden Ansatz zur Profilerstellung des tumorimmunen Mikroumfelds über multiple feste Malignome hinweg, um einen Atlas der Tumorbiologie bereitzustellen. Um diesen Atlas zu erstellen, haben wir ein MERFISH-Panel von 500 Genen erstellt, die über 40 Zellphänotypisierungswege und Dutzende von Signalwegen einschließlich Chemokinen, Zytokinen, Interferon und Ligand-Rezeptor-Interaktionen repräsentieren. Dieses Panel wurde bei 15 Patienten eingesetzt, die mehrere feste Malignome repräsentieren. Wir haben auch das auf Immun-Onkologie fokussierte Xenium-Panel genutzt, um 16 verschiedene Patienten über dieselben Indikationen hinweg zu profilieren. Mit den Xenium-Daten haben wir gleichzeitig die proteomische Expression mithilfe eines 16-Plex-Panels erfasst, das auf Immun-Onkologie-Ziele fokussiert war, und anschließend Teil 2 der H-Studie (Späteinreichungen, klinische Studien und eingeladene Abstracts); 5.-10. April 2024; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84 (7Suppl): Abstract Nr LB331.