Erweiterte Auflösungsprofilierung bei Zwillingen zeigt Unterschiede in den Methylierungssignaturen von Typ-2-Diabetes mit Verbindungen zu seinen Komplikationen

ZusammenfassungHintergrundDie Anfälligkeit für Typ-2-Diabetes (T2D) wird durch genetische und umweltbedingte Faktoren beeinflusst. Frühere Befunde deuten darauf hin, dass DNA-Methylierung ein potenzieller Mechanismus bei der Pathogenese und Progression von T2D sein könnte. MethodenWir profilierten die DNA-Methylierung in 248 Blutproben von Teilnehmern europäischer Abstammung aus 7 Zwillingskohorten unter Verwendung einer Methylierungs-Sequenzierungsplattform, die regulatorische genomische Regionen mit 2.048.698 CpG-Stellen anvisiert. ErgebnisseWir fanden und replizierten 3 zuvor nicht berichtete, differenziell methylierten CpG-Positionen (T2D-DMPs) bei FDR 5 % in RGL3, NGB und OTX2 sowie 20 Signale bei FDR 25 %, von denen 14 repliziert wurden. Durch die Integration genetischer Variation und T2D-diskordanter monozygotischer Zwillingsanalysen identifizieren wir sowohl genetisch basierte als auch genetisch unabhängige T2D-DMPs. Die Signale annotieren zu Genen mit etablierten GWAS- und EWAS-Verbindungen zu T2D und seinen Komplikationen, einschließlich Blutdruck (RGL3) und Augenerkrankungen (OTX2). InterpretationDie Ergebnisse helfen, unser Verständnis der Pathogenese und Progression von T2D zu verbessern und könnten Biomarker für seine Komplikationen bieten. FinanzierungDie Danksagungen zur Finanzierung für jede Kohorte finden Sie im ergänzenden Hinweis.