Analyse der kultivierbaren bakteriellen Diversität des Pangong Tso Sees mittels eines 16S rRNA Tag-Sequenzierungsansatzes

Der Pangong Tso See ist ein Hochgebirgs-Freshwater-Habitat, in dem die ansässigen Mikroben einzigartigen Selektionsdrücken ausgesetzt sind, d.h. hoher Strahlung, niedrigem Nährstoffgehalt, Austrocknung und Temperaturenextremen. Unsere Studie versucht, die Diversität kultivierbarer Bakterien zu analysieren, indem ein Hochdurchsatz-Amplikon-Sequenzierungsansatz auf Basis der Langread-Technologie angewendet wird, um das Spektrum der bakterielle Diversität zu bestimmen, die durch axenisches Medium unterstützt wird. Die Phyla Pseudomonadota, Bacteriodetes und Actinomycetota wurden als die vorherrschenden Taxa in Wasser- und Sedimentproben identifiziert. Die Gattungen Hydrogenophaga und Rheinheimera, Pseudomonas, Loktanella, Marinomonas und Flavobacterium waren in den Sediment- und Wasserproben reichlich vorhanden. Niedrige Nährstoffbedingungen unterstützten das Wachstum von Taxa innerhalb der Phyla Bacteriodetes, Actinomycetota und Cyanobakterien und waren auf die Auswahl von Pseudomonas, Hydrogenophaga, Bacillus und Enterococcus spp. ausgerichtet. Unsere Studie empfiehlt, dass Medienformulierungen nach der Analyse der kultivierbaren Diversität durch einen Hochdurchsatz-Sequenzierungsansatz finalisiert werden können, um maximale Artenvielfalt mit Fokus auf neuartige/ relevante Taxa zu erreichen.