Identifizierung von Kandidatengen und -wegen, die mit dem Temperamentmerkmal bei Schafen verbunden sind

Temperament kann definiert werden als die emotionale Variabilität unter Tieren derselben Art als Reaktion auf denselben Reiz, wobei Tiere nach ihrer Reaktivität in nervös, intermediär oder ruhig eingeteilt werden. Unser Ziel war es, genomische Regionen mit dem Temperamentphänotyp, gemessen durch den Isolation Box Test (IBT), durch eindimensionale genomeweite Assoziationsstudien (ssGWAS) zu identifizieren. Die Datenbank bestand aus 4317 Tieren mit Temperamentaufzeichnungen und 1697 genotypisierten Tieren mit 38.268 effektiven Einzel-Nukleotid-Polymorphismen (SNP) nach der Qualitätskontrolle. Wir identifizierten drei genomische Regionen, die den größten Prozentsatz der genetischen Varianz erklärten, was zu 25 SNP führte, die mit Kandidatengen auf den Chromosomen 6, 10 und 21 assoziiert sind. Insgesamt werden neun Kandidatengene für das Temperamentmerkmal berichtet, und zwar: PYGM, SYVN1, CAPN1, FADS1, SYT7, GRID2, GPRIN3, EEF1A1 und FRY, die mit der energetischen Aktivität des Organismus, der synaptischen Übertragung, der Fleischzartheit und mit Calcium assoziierten Aktivitäten verbunden sind. Dies ist die erste Studie, die diese genetischen Varianten identifiziert, die mit dem Temperament bei Schafen assoziiert sind und die als molekulare Marker in zukünftigen Verhaltensforschungen verwendet werden könnten.