Der RNA-Interferenz (RNAi)-Weg ist ein epigenetischer Mechanismus, der kürzlich aufgrund seiner Rolle bei der Regulierung der Virulenz von Pflanzenpathogenen Aufmerksamkeit erregt hat. Es ist jedoch wenig über diesen Genstilllegungsweg in Phytophthora capsici bekannt, einem breit angelegten Pathogen, das viele wichtige Nahrungsmittelpflanzen betrifft. In der vorliegenden Studie identifizierten wir Schlüsselgene und -proteine, die an der Synthese, dem Transport und der Verarbeitung von sRNAs beteiligt sind, wobei wir in silico Ansätze basierend auf dem Referenzgenom und -proteom sowie durch transkriptionale Analysen von P. capsici verwendeten. Unsere Ergebnisse zeigten, dass das Genom von P. capsici Dcl1, Dcl2, Exportin-5, Rdr und sechs Ago-Proteine kodiert, was auf das Vorhandensein eines vollständigen RNAi-Wegs in diesem Pathogen hindeutet. Diese Gene waren syntenisch und phylogenetisch mit denen anderer Oomyceten der Gattung Phytophthora verwandt. Wir analysierten auch ihre Expressionsniveaus nach der Infektion von Chilischoten und Brokkoli über zwei Generationen, was unterschiedliche Ausdrucksmuster je nach Infektionsgeschichte des Pathogens ergab. Soweit uns bekannt ist, handelt es sich um den ersten Bericht über das EXPORTIN-5-Gen in P. capsici und anderen Oomyceten. Darüber hinaus deutet die Expression all dieser RNAi-bezogenen Gene im Pathogen nach der Isolation von verschiedenen Wirten darauf hin, dass der Wirt den RNAi-Weg von P. capsici beeinflussen kann. Diese Studie ebnet den Weg für funktionale Studien zur Bestätigung der Rolle von RNAi bei der Regulierung der Virulenz in P. capsici.
Sevillano-Serrano et al. (Fr.,) untersuchten diese Frage.