Ein klinisch anwendbares Konnektivitätszeichen für Glioblastome umfasst den Tumornetzwerktreiber CHI3L1

Tumormikroröhren (TMs) verbinden Gliomzellen mit einem Netzwerk, das erhebliche Relevanz für das Tumorprogression und die Therapieresistenz hat. Die Bestimmung der TM-Interkonnektivität in einzelnen Tumoren ist jedoch herausfordernd, und der Einfluss auf das Überleben der Patienten bleibt unklar. Hier etablieren wir ein Konnektivitätszeichen aus einzelnem Zell-RNA-sequenzierten (scRNA-Seq) xenogeflügelten primären Glioblastom (GB)-Zellen unter Verwendung einer Farbstoffaufnahme-Methodik und validieren es mit der Aufzeichnung von zellulären Calcium-Epochen und klinischen Korrelationen. Astrozyten-ähnliche und mesenchym-ähnliche GB-Zellen haben die höchsten Konnektivitätszeichenwerte in scRNA-sequenzierten patientenabgeleiteten Xenograft- und Patientenproben. In großen GB-Kohorten korreliert die TM-Netzwerkkonnektivität mit dem mesenchymalen Subtyp und einem düsteren Überleben der Patienten. Die CHI3L1-Genexpression dient als robuster molekularer Marker für Konnektivität und beeinflusst funktionell die TM-Netzwerke. Das Konnektivitätszeichen ermöglicht Einblicke in die Biologie von Gehirntumoren, bietet einen Nachweis dafür, dass die TM-Konnektivität der Tumorzellen für die Prognose der Patienten relevant ist, und dient als robuster prognostischer Biomarker.