Extraktion und Bewertung des Wissens über aufkommende negative Ergebnis-Pfade

Während die Gemeinschaft der toxikologischen Forscher, Risikobewerter und Risikomanager das Rahmenwerk der negativen Ergebnis-Pfade (AOP) zur Organisation toxikologischen Wissens übernimmt, wächst die Anzahl und Vielfalt der AOPs in der Online-AOP-Wissensdatenbank (KB) weiterhin. Um dieses Wachstum zu verfolgen und zu untersuchen, wurden die AOPs in der AOP-KB in einem einzigen Netzwerk zusammengefasst. Zusammenfassende Maßnahmen zum aktuellen Stand der AOP-KB sowie zur Gesamtkonnektivität und den strukturellen Merkmalen des resultierenden Netzwerks wurden berechnet. Unsere Ergebnisse zeigen, dass das Netzwerken der 187 benutzerdefinierten AOPs, die derzeit in der AOP-KB beschrieben sind, zur Entstehung von 9405 einzigartigen, zuvor nicht beschriebenen, linearen AOPs (LAOPs) führte. Um Muster in diesem aufkommenden Wissen zu untersuchen, haben wir das AOP-KB-Netzwerk retrospektiv zusammengestellt, indem wir nacheinander jedes der 187 benutzerdefinierten AOPs hinzugefügt haben, und festgestellt, dass die Schaffung neuer AOPs, die Komponenten von zuvor bestehenden AOPs in der KB entlehnt haben, am häufigsten die Entstehung neuer LAOPs beschrieben hat. Allerdings spielen auch die Einführung von nicht benachbarten Schlüsselereignisbeziehungen und Zyklen unter KEs eine entscheidende Rolle bei den entstehenden LAOPs. Wir geben Beispiele dafür, wie man anwendungsspezifische kritische Pfade aus dieser großen Anzahl von LAOPs identifizieren kann. Unsere Forschung zeigt, dass das globale AOP-Netzwerk beträchtlichen Wert als Quelle für aufkommendes toxikologisches Wissen haben könnte. Diese Erkenntnisse sind nicht nur hilfreich, um die Natur dieser aufkommenden Informationen zu verstehen, sondern können auch genutzt werden, um die zukünftige Entwicklung der AOP-KB zu steuern und wie man diesen Reichtum an Informationen an spezifische Anwendungen anpassen kann.