Statistische Analysen und reproduzierbare Forschung

Es ist wichtig, wenn nicht sogar wesentlich, die Berechnungen und den Code, die in Datenanalysen, methodologischen Beschreibungen, Simulationen usw. verwendet werden, mit den Dokumenten zu integrieren, die sie beschreiben und auf die sie sich stützen. Diese Integration ermöglicht es den Lesern, die Aussagen in den Dokumenten sowohl zu überprüfen als auch anzupassen. Autoren können die Ergebnisse in der Zukunft leicht reproduzieren und sie können den Inhalt des Dokuments in einem anderen Medium präsentieren, beispielsweise mit interaktiven Steuerungen. In diesem Artikel wird ein Softwareframework beschrieben, das sowohl das Erstellen als auch das Verteilen dieser integrierten, dynamischen Dokumente ermöglicht, die Text, Code, Daten und alle erforderlichen Hilfsinhalte enthalten, um die Berechnungen wiederherzustellen. Die Dokumente sind dynamisch, da die Inhalte – einschließlich Grafiken, Tabellen usw. – jedes Mal neu berechnet werden können, wenn eine Ansicht des Dokuments generiert wird. Unser Modell behandelt ein dynamisches Dokument als ein Master- oder „Quell“-Dokument, aus dem verschiedene Ansichten in Form von traditionellen, abgeleiteten Dokumenten für unterschiedliche Zielgruppen generiert werden können. Wir führen das Konzept eines Kompendiums als Container für ein oder mehrere dynamische Dokumente und die verschiedenen Elemente ein, die bei deren Verarbeitung benötigt werden, wie Code und Daten. Das Kompendium dient als Mittel zur Verteilung, Verwaltung und Aktualisierung der Sammlung. Der Schritt von der Verbreitung von Analysen über ein Kompendium hin zu reproduzierbarer Forschung ist ein kleiner. Mit reproduzierbarer Forschung meinen wir Forschungsarbeiten mit begleitenden Softwaretools, die es dem Leser ermöglichen, die Ergebnisse direkt zu reproduzieren und die in dem Forschungspapier präsentierten Berechnungsmethoden anzuwenden. Einige der Probleme, die mit Paradigmen für die Produktion, Verteilung und Nutzung solcher reproduzierbarer Forschung verbunden sind, werden diskutiert.