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Aktinobakterien, insbesondere die der Gattung Streptomyces, bleiben unschätzbare Wirte für die Entdeckung und Konstruktion von Naturprodukten sowie deren zugehörigen biosynthetischen Wegen. Allerdings ist die genetische Manipulation dieser Bakterien oft arbeits- und zeitintensiv. Hier präsentieren wir ein modifiziertes CRISPR/Cas-System für ein schnelles Multiplex-Genome Editing von Streptomyces-Stämmen, das gezielte chromosomale Deletionen in drei verschiedenen Streptomyces-Arten und in verschiedenen Größen (von 20 bp bis 30 kb) mit einer Effizienz von 70 bis 100 % demonstriert. Die entwickelten pCRISPomyces-Plasmide sind für den Zusammenbau von Spacer- und Editiervorlagen über Golden Gate Assembly und isothermische Assembly (oder traditionelle Verdau/Ligation) geeignet und ermöglichen einen schnellen Plasmidbau zur Zielung beliebiger genomischer Loci von Interesse. Somit stellt das pCRISPomyces-System ein leistungsstarkes neues Werkzeug für das Genome Editing in Streptomyces dar.
Cobb et al. (Di,) haben diese Frage untersucht.
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