Key points are not available for this paper at this time.
Die fluoreszierende Markierung von Nukleinsäuren wird in der Grundlagenforschung und in medizinischen Anwendungen weit verbreitet. Wir beschreiben die effiziente, ortsspezifische Einbau eines fluoreszierenden Basenanalogons, 2-Amino-6-(2-Thienyl)purin (s), in RNA durch Transkription, die durch ein unnatürliches Basenpaar zwischen s und Pyrrol-2-carbaldehyd (Pa) vermittelt wird. Das Ribonukleosid 5'-Triphosphat von s wurde ortsspezifisch in RNA integriert, durch T7 RNA-Polymerase, gegenüber Pa in DNA-Vorlagen. Die Fluoreszenzintensität von s in RNA-Molekülen ändert sich je nach strukturellem Umfeld. Die ortsspezifische s-Markierung von RNA-Haarnadeln und tRNA-Molekülen lieferte charakteristische fluoreszierende Profile, abhängig von den Markierungsstellen, der Temperatur und der Mg2+-Konzentration. Die Pa-haltigen DNA-Vorlagen können durch PCR unter Verwendung von 7-(2-Thienyl)imidazo4,5-bpyridin (Ds), einem weiteren Partner von Pa, amplifiziert werden. Diese ortsspezifische fluoreszierende Probenahme durch das unnatürliche Paarsystem, einschließlich der s-Pa- und Ds-Pa-Paare, bietet ein leistungsstarkes Werkzeug zur Untersuchung der Dynamik der lokalen strukturellen Merkmale von 3D-RNA-Molekülen und ihrer intra- und intermolekularen Wechselwirkungen.
Kimoto et al. (Mi,) untersuchten diese Frage.