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Die Drug-Gene Interaction Database (DGIdb, www.dgidb.org) ist eine Webressource, die Informationen über Drug-Gene-Interaktionen und druggable Gene aus Publikationen, Datenbanken und anderen webbasierten Quellen bereitstellt. Daten zu Medikamenten, Genen und Interaktionen werden normalisiert und in konzeptionelle Gruppen zusammengeführt. Die in dieser Ressource enthaltenen Informationen sind für Nutzer über eine einfache Suchoberfläche, eine Anwendungsprogrammierschnittstelle (API) und TSV-Daten-Downloads verfügbar. DGIdb 4.0 ist die neueste Hauptversion dieser Datenbank. Ein zentrales Anliegen dieses Updates war die Integration mit crowdsourced Initiativen, wobei die Drug Target Commons für gemeinschaftlich beigesteuerte Interaktionsdaten, Wikidata zur Erleichterung der Begriffsnormierung und der Export zu NDEx für Darstellungen von Drug-Gene-Interaktionsnetzwerken genutzt wurden. Seit der letzten Hauptversion wurden sieben neue Quellen hinzugefügt, wodurch die Gesamtzahl der einbezogenen Quellen auf 41 gestiegen ist. Von den zuvor aggregierten Quellen wurden 15 aktualisiert. DGIdb 4.0 umfasst auch Verbesserungen im Prozess der Normalisierung von Medikamenten und der Gruppierung importierter Quellen. Weitere bemerkenswerte Updates sind die Einführung eines ausgefeilteren Query Scores für Interaktionssuchergebnisse, ein aktualisierter Interaktionsscore, die Aufnahme der Interaktionsrichtung und mehrere zusätzliche Verbesserungen der Suchfunktionen, Datenfreigaben, Lizenzdokumentation und des Anwendungsframeworks.
Freshour et al. (Fri,) haben diese Frage untersucht.