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Reptilien mit zwei temporalen Öffnungen im Schädel werden allgemein in zwei Gruppen unterteilt – die Lepidosauria (Eidechsen, Schlangen, Sphenodon, ‚Eosuchians‘) und die Archosauria (Krokodile, Thecodontier, Dinosaurier, Pterosaurier). Neuere Vorschläge, dass diese beiden keine Schwestergruppen sind, haben sich als unbegründet erwiesen, während es starke Beweise dafür gibt, dass sie eine monophyletische Gruppe bilden, die Diapsida, basierend auf mehreren Synapomorphien lebender und fossiler Formen. Eine kladistische Analyse von Schädel- und Skelettmerkmalen aller beschriebenen Permo-Triassischen Diapsiden-Reptilien legt einige bedeutende Umstellungen der allgemein akzeptierten Ansichten nahe. Die Gattung Petrolacosaurus ist die Schwestergruppe aller späteren Diapsiden, die in zwei große Gruppen fallen – die Archosauromorpha (Pterosauria, Rhynchosauria, Prolacertiformes, Archosauria) und die Lepidosauromorpha (Younginiformes, Sphenodontia, Squamata). Die Pterosaurier sind keine Archosaurier, aber sie sind die Schwestergruppe aller anderen Archosauromorphen. Es gibt keine enge Beziehung zwischen Rhynchosauriern und Sphenodontiden, noch zwischen Prolacerta oder Tanystropheus und Eidechsen. Die Begriffe ‚Eosuchia‘, ‚Rhynchocephalia‘ und ‚Protorosauria‘ sind in ihrer Anwendung zu weit geworden und werden nicht mehr verwendet. Eine kladistische Klassifikation der Diapsida wird gegeben, ebenso ein phylogenetischer Baum, der kladistische und stratigraphische Daten verwendet.
Michael J. Benton (Sa,) untersuchte diese Frage.