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Diese Überarbeitung der Klassifikation der einzelligen Eukaryoten aktualisiert die von Levine et al. (1980) für die Protozoen und erweitert sie um andere Protisten. Während die vorherige Überarbeitung hauptsächlich dazu diente, die Ergebnisse ultrastruktureller Studien einzubeziehen, berücksichtigt diese Überarbeitung Ergebnisse sowohl aus ultrastrukturellen Forschungen seit 1980 als auch aus molekularphylogenetischen Studien. Wir schlagen ein Schema vor, das auf namenlosen, rangierten Systematiken basiert. Der Wortschatz der Taxonomie wurde aktualisiert, insbesondere um die Benennung von Gruppen zu klären, die umpositioniert wurden. Wir erkennen sechs Cluster von Eukaryoten an, die die grundlegenden Gruppierungen darstellen könnten, ähnlich den traditionellen "Reichen". Die mehrzelligen Linien entstanden innerhalb monophyletischer Protistenlinien: Tiere und Pilze aus Opisthokonta, Pflanzen aus Archaeplastida und Braunalgen aus Stramenopiles.
Adl et al. (Sat,) untersuchten diese Frage.