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Die experimentelle Charakterisierung und die rechnergestützte Vorhersage von Proteinstrukturen haben sich zunehmend schnell und präzise entwickelt. Die Analyse von Proteinstrukturen erfordert jedoch oft, dass Forscher mehrere Softwarepakete oder Webserver verwenden, was die Angelegenheit kompliziert. Um die lang etablierten strukturellen Analysen in einer modernen, benutzerfreundlichen Schnittstelle bereitzustellen, haben wir ProteinTools implementiert, ein Webserver-Toolkit zur Analyse von Proteinstrukturen. ProteinTools bündelt bisher vier Anwendungen, nämlich die Identifikation von hydrophoben Clustern, Wasserstoffbrücken-Netzwerken, Salzbrücken und Kontaktkarten. In allen Fällen sind die Eingabedaten ein PDB-Identifikator oder eine hochgeladene Struktur, während die Ausgabe eine interaktive dynamische Webschnittstelle ist. Dank der modularen Natur von ProteinTools wird die Hinzufügung neuer Anwendungen zu einer einfachen Aufgabe. Angesichts des aktuellen Bedarfs, diese Werkzeuge in einer einzigen, schnellen und interpretierbaren Schnittstelle zu haben, glauben wir, dass ProteinTools ein unverzichtbares Toolkit für die breitere Protein-Forschungsgemeinschaft werden wird. Der Webserver ist verfügbar unter https://proteintools.uni-bayreuth.de.
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Noelia Ferruz
Universitat Pompeu Fabra
Steffen Schmidt
University of Southern Denmark
Birte Höcker
University of Bayreuth
Nucleic Acids Research
University of Bayreuth
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Ferruz et al. (Mon,) studied this question.
synapsesocial.com/papers/69dd5fa92f737f012599bd46 — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab375
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