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Die Protein-Interaktionsnetzwerk-Analyse (PINA) Plattform ist eine umfassende webbasierte Ressource, die eine Datenbank einheitlicher Protein-Protein-Interaktionsdaten umfasst, die aus sechs manuell kuratierten öffentlichen Datenbanken integriert ist, sowie eine Reihe integrierter Werkzeuge für den Netzwerkaufbau, die Filterung, Analyse und Visualisierung. Die zweite Version von PINA verbessert ihre Nützlichkeit für Studien der Proteininteraktionen auf Netzwerkebene, indem sie mehrere Sammlungen von Interaktionsmodulen einbezieht, die durch verschiedene Clusteransätze aus dem gesamten Netzwerk der Proteininteraktionen ('Interaktom') für sechs Modelltierarten identifiziert wurden. Alle identifizierten Module sind vollständig annotiert mit angereicherten Gen-Ontologie-Begriffen, KEGG-Wegen, Pfam-Domänen sowie der Sammlung chemischer und genetischer Störungen aus MSigDB. Darüber hinaus wird ein neues Werkzeug für die Modul-Anreicherungsanalyse bereitgestellt, zusätzlich zur einfachen Abfragefunktion. Die Interaktom-Daten sind ebenfalls über die Website für weitere bioinformatische Analysen verfügbar. PINA ist frei zugänglich unter http://cbg.garvan.unsw.edu.au/pina/.
Cowley et al. (Di.) haben diese Frage untersucht.
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