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Metabolische Austauschprozesse sind allgegenwärtig in mikrobiellen Gemeinschaften. Die Erkennung von Metaboliten-Kreuzfütterungen ist jedoch aufgrund ihrer intrinsisch dynamischen Natur und der Komplexität der Gemeinschaften schwierig. Während die umfassende Beschreibung von Stoffwechselnetzwerken, die in natürlichen Systemen funktionieren, eine Aufgabe für die Zukunft darstellt, liegt die unmittelbare Herausforderung heute in der detaillierten Charakterisierung kleiner, komplexitätsreduzierter mikrobielle Konsortien und der Fokussierung auf bestimmte metabolische Aspekte natürlicher Ökosysteme. Die Erkennung metabolischer Interaktionen erfordert eine methodische Kombination, die in der Lage ist, die Identität der Arten, Abhängigkeiten und die Natur der ausgetauschten Metaboliten zu erfassen. Verschiedene Kombinationen diverser Techniken, von Metagenomik bis hin zu bildgebender Massenspektrometrie, bieten Lösungen für diese Herausforderung, wobei jede Kombination auf die jeweilige Gemeinschaft zugeschnitten ist.
Ponomarova et al. (Fri,) untersuchten diese Frage.