Evolutionsbeziehungen zwischen verschiedenen Bakteriophagen und Prophagen: Die ganze Welt ist ein Phage

Wir berichten über DNA- und vorhergesagte Proteinsequenzähnlichkeiten, die auf Homologie hindeuten, unter Genen von doppelsträngiger DNA (dsDNA) Bakteriophagen und Prophagen, die ein breites phylogenetisches Spektrum von Wirtbakterien abdecken. Die hier berichteten Sequenzübereinstimmungen etablieren genetische Verbindungen, die nicht immer direkt sind, zwischen den lambdoiden Phagen von Escherichia coli, dem Phage phiC31 von Streptomyces, Phagen von Mycobacterium, einem zuvor unentdeckten kryptischen Prophage, phiflu, im Genom von Haemophilus influenzae, und zwei kleinen phageähnlichen Elementen, phiRv1 und phiRv2, im Genom von Mycobacterium tuberculosis. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass diese Phagen-Gene, und sehr wahrscheinlich alle dsDNA-schwänzigen Phagen, gemeinsame Vorfahren teilen. Wir schlagen ein Modell für die genetische Struktur und Dynamik der globalen Phagenpopulation vor, in dem alle dsDNA-Phagengeneome Mosaike sind mit Zugang, durch horizontalen Austausch, zu einem großen gemeinsamen genetischen Pool, aber in dem der Zugang zum Genpool nicht für alle Phagen einheitlich ist.