Rückwärts-mutationales Scannen des SARS-CoV-2 Spike BA.2.86 identifiziert Epitopen, die zur Immunflucht aus polyklonalen Seren beitragen

Die kürzlich entdeckte Omikron-BA.2.86-Linie enthält mehr als 30 Aminosäuremutationen im Vergleich zu BA.2. BA.2.86 und ihr JN.1-Derivat entkommen der Neutralisierung durch Serum-Antikörper vollständig geimpfter Personen. In dieser Studie erhellen wir Epitopen, die die Immunflucht von BA.2.86 und JN.1 mittels Pseudovirus-Neutralisierung antreiben. Hier generieren wir 33 BA.2.86-Mutanten, bei denen jeweils eine einzelne Mutation zurück zu BA.2 revertiert wird. Wir verwenden diese Bibliothek in einem Ansatz, den wir rückwärts-mutationales Scannen nennen, um unterschiedliche Neutralisationstiter gegen jedes Epitope zu definieren. Mutationen im Rezeptorbindungsbereich bei K356T, V483Δ und in geringerem Maße N460K, A484K und F486P verstärken die Immunflucht. Interessanterweise tragen 16insMPLF im N-terminalen Bereich des Spike und P621S innerhalb von S1/S2 ebenfalls erheblich zur Antikörperflucht von BA.2.86 bei. Nach der Booster-Impfung mit XBB.1.5 verbessern sich die Neutralisationstiter gegen JN.1 und BA.2.86 erheblich, und die restliche Immunflucht wird von 16insMPLF, N460K, E554K und in geringerem Maße P621S und A484K angetrieben.