Einzelzell- und räumliche Transkriptomik zeigen POSTN+ tumorassoziierte Fibroblasten, die mit immunologischer Suppression und Tumorprogression bei nicht-kleinzelligem Lungenkrebs korreliert sind

HINTERGRUND: Tumorassoziierte Fibroblasten (CAFs) sind potenzielle Ziele für die Krebsbehandlung. Aufgrund der Heterogenität der CAFs ist der Einfluss von CAF-Unterpopulationen auf die Progression von Lungenkrebs noch unklar, was die translationalen Fortschritte bei der gezielten Behandlung von CAFs behindert. METHODEN: Wir führten eine Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scRNA-seq) an Tumor-, gepaarten tumor-adjazen und normalen Proben von 16 Patienten mit nicht-kleinzelligem Lungenkrebs (NSCLC) durch. CAF-Unterpopulationen wurden nach der Integration mit veröffentlichten NSCLC scRNA-seq-Daten analysiert. Räumlich verbesserte Auflösungs-Omik-Sequenzierung (Stereo-seq) wurde an Tumor- und tumor-adjazen Proben von sieben NSCLC-Patienten angewendet, um die Architektur der Hauptzellpopulationen im Tumormikroumfeld (TME) zu kartieren. Immunhistochemie (IHC) und multiplexierte IHC (mIHC) wurden verwendet, um die Expression von Marker-Genen und die Assoziation von CAFs mit Immuninfiltration im TME zu validieren. ERGEBNISSE: CAFs waren mit einer schlechten Prognose von NSCLC assoziiert. SCHLUSSFOLGERUNGEN: CAFs, die mit der Krebsprogression und schlechten klinischen Ergebnissen assoziiert sind, könnten neue Einblicke in die Behandlung von NSCLC bieten.