Multilocus-Sequenztypisierung von Cronobacter sakazakii und Cronobacter malonaticus offenbart stabile klonale Strukturen mit klinischer Relevanz, die nicht mit Biotypen korrelieren.

HINTERGRUND: Die Gattung Cronobacter (Enterobacter sakazakii) ist aufgrund ihrer Assoziation mit Säuglingsinfektionen und dem Verzehr von kontaminierter rekonstituierter Säuglingsnahrung in den Vordergrund gerückt. C. sakazakii und C. malonaticus sind eng verwandt und werden nach ihrem Biotyp definiert. Aufgrund der ubiquitär vorhandenen Organismen und der hohen Schwere von Infektionen bei immungeschwächten Personen wurde ein Multilocus-Sequenztypisierungs (MLST) Schema entwickelt, um C. sakazakii- und C. malonaticus-Stämme schnell und zuverlässig zu identifizieren und zu unterscheiden. Es wurde auf 60 Stämme von C. sakazakii und 16 Stämme von C. malonaticus angewendet, einschließlich der Indexstämme, die zur Definition der Biotypen verwendet wurden. Die Stämme stammten aus klinischen und nicht-klinischen Quellen zwischen 1951 und 2008 in den USA, Kanada, Europa, Neuseeland und dem Fernen Osten. ERGEBNISSE: Dieses Schema verwendet 7 Loci; atpD, fusA, glnS, gltB, gyrB, infB und pps. Es wurden 12 Sequenztypen (ST) in C. sakazakii und 3 in C. malonaticus identifiziert. Ein Drittel (22/60) der C. sakazakii-Stämme befand sich in ST4, das fast gleich viele klinische und Säuglingsnahrungsisolierte von 1951 bis 2008 hatte. ST8 könnte eine besonders virulente Gruppierung von C. sakazakii darstellen, da 7/8 Stämme klinischen Ursprungs waren, die zwischen 1977 und 2006 aus vier Ländern isoliert wurden. C. malonaticus wurde in drei STs unterteilt. Das vorherige Cronobacter-Biotypisierungsschema entsprach nicht klar den STs oder Spezies. FAZIT: Zusammenfassend ist MLST ein robusteres Mittel zur Identifizierung und Unterscheidung zwischen C. sakazakii und C. malonaticus als die Biotypisierung. Die MLST-Datenbank für diese Organismen ist online verfügbar unter http://pubmlst.org/cronobacter/.