Die komplette genomische Sequenz von Nocardia farcinica IFM 10152

Wir haben die genomische Sequenz von Nocardia farcinica IFM 10152, einem klinischen Isolat, bestimmt und die molekularen Grundlagen seiner Vielseitigkeit aufgedeckt. Das Genom besteht aus einem einzelnen zirkulären Chromosom von 6.021.225 bp mit einem durchschnittlichen G+C-Gehalt von 70,8 % und zwei Plasmiden von 184.027 (pNF1) und 87.093 (pNF2) bp mit durchschnittlichen G+C-Gehalten von 67,2 % bzw. 68,4 %. Das Chromosom kodiert 5.674 putative protein-codierende Sequenzen, einschließlich vieler Kandidatengene für Virulenz und Multidrug-Resistenz sowie für sekundären Metabolismus. Analysen paraloger Proteinfamilien deuten darauf hin, dass Gen- Duplikationen zu einem Bakterium geführt haben, das nicht nur in Bodenumgebungen, sondern auch in tierischem Gewebe überleben kann, was zu Krankheiten führt.