Lso2 ist ein konserviertes ribosomengebundenes Protein, das für die translationsbedingte Erholung in Hefen erforderlich ist

Ribosomenbindende Proteine spielen eine umfassende Rolle in der Proteinsynthese, der Genregulation und der zellulären Homöostase, aber das vollständige Komplement an funktionellen ribosomengebundenen Proteinen bleibt unbekannt. Durch quantitative Massenspektrometrie identifizierten wir das spät annotierte kurze offene Leserahmen-Protein 2 (Lso2) als ein ribosomenassoziiertes Protein, das in Eukaryoten weitgehend konserviert ist. Genomweite Kreuzvernetzung und Immunpräzipitation von Lso2 und seinem menschlichen Orthologen, dem Coiled-Coil-Domäne enthaltenden Protein 124 (CCDC124), ergaben 25S ribosomale RNA in einem Bereich nahe der A-Stelle, der sich mit dem GTPase-Aktivierungszentrum überschneidet. In Übereinstimmung mit diesem Standort verlinkte Lso2 auch mit den meisten tRNAs. Die Ribosomenprofilierung von Hefen ohne LSO2 (lso2) zeigte globale Translationsdefekte während der Erholung aus der stationären Phase, wobei die Translation der meisten Gene um mehr als das Vierfache reduziert war. Ribosomen akkumulierten an Startkodons, waren von Stoppkodons erschöpft und zeigten kodonspezifische Veränderungen in der Belegung bei lso2. Diese Defekte und die Konservierung der spezifischen ribosomenbindenden Aktivität von Lso2/CCDC124 weisen auf weitreichend wichtige Funktionen in der Translation und Physiologie hin.