PDZ-Domänen und die Organisation von supramolekularen Komplexen

PDZ-Domänen sind modulare Protein-Interaktionsdomänen, die in einer sequenzspezifischen Weise an kurze C-terminale Peptide oder interne Peptide binden, die sich zu einem Beta-Finger falten. Die Vielfalt der PDZ-Bindungsspezifitäten kann durch variable Aminosäuren, die die Peptidbindungsrinne der PDZ-Domäne umgeben, erklärt werden. Häufig in Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster und Säugetiergenomen vertreten, kommen PDZ-Domänen häufig in mehreren Kopien vor oder sind mit anderen proteinbindenden Motiven in multidomänen Scaffold-Proteinen assoziiert. PDZ-haltige Proteine sind typischerweise an der Assemblierung supramolekularer Komplexe beteiligt, die lokalisierte Signalverbreitungsfunktionen an bestimmten subzellulären Orten ausüben. Die Organisation rund um ein auf PDZ basierendes Gerüst ermöglicht die stabile Lokalisierung von interagierenden Proteinen und erhöht die Geschwindigkeit und Genauigkeit der Signaltransduktion innerhalb des Komplexes. Einige PDZ-haltige Proteine werden dynamisch hinsichtlich ihrer Verteilung reguliert und können auch am Transport interagierender Proteine innerhalb der Zelle beteiligt sein.