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Datamonkey ist eine beliebte webbasierte Suite von phylogenetischen Analysetools für die Verwendung in der Evolutionsbiologie. Seit der ursprünglichen Veröffentlichung im Jahr 2005 haben wir die Analyseoptionen erweitert, um neu entwickelte algorithmische Methoden zur Rekombinationsentdeckung, evolutionäre Fingerabdrücke von Genen, Auswahl von Kodonmodellen, Koevolution zwischen Stellen, Identifizierung von Stellen, die schnell dem Immundruck des Wirts entkommen, und Zuweisung von HIV-1-Subtypen einzuschließen. Die traditionellen Auswahltools wurden ebenfalls erweitert, um aktuelle Entwicklungen auf diesem Gebiet zu berücksichtigen. Hier fassen wir die derzeit auf Datamonkey verfügbaren Analyseoptionen zusammen und geben Richtlinien für ihre Verwendung in der Evolutionsbiologie. Verfügbarkeit und Dokumentation: http://www.datamonkey.org.
Delport et al. (Thu,) haben diese Frage untersucht.