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Die Sequenz von 1.852.442 bp eines M1-Stammes von Streptococcus pyogenes, einem grampositiven Erreger, wurde bestimmt und enthält 1.752 vorhergesagte proteincodierende Gene. Etwa ein Drittel dieser Gene hat keine identifizierbare Funktion, während die verbleibenden in zuvor charakterisierte Kategorien bekannter mikrobieller Funktionen fallen. Konsistent mit der Beobachtung, dass S. pyogenes für eine breitere Palette menschlicher Krankheiten verantwortlich ist als jede andere Bakterienart, wurden mehr als 40 vermeintlich virulenzassoziierte Gene identifiziert. Weitere Gene wurden identifiziert, die Proteine kodieren, die wahrscheinlich mit der mikrobiellen "molekularen Mimikry" von Wirtsmerkmalen assoziiert sind und an rheumatischem Fieber oder akuter Glomerulonephritis beteiligt sind. Die vollständige oder partielle Sequenz von vier verschiedenen Bakteriophagen-Genomen ist ebenfalls vorhanden, wobei jedes Gene für ein oder mehrere zuvor unentdeckte superantigen-ähnliche Proteine enthält. Diese mit Prophagen assoziierten Gene kodieren mindestens sechs potenzielle Virulenzfaktoren, was die Bedeutung von Bakteriophagen beim horizontalen Gentransfer und einen möglichen Mechanismus zur Erzeugung neuer Stämme mit erhöhtem pathogenem Potenzial unterstreicht.
Ferretti et al. (Diens.) haben diese Frage untersucht.