Außergewöhnlich hohe evolutive Rate von Pseudogenen: Beweise für das Vorhandensein von Selektionsdruck gegen Veränderungen zwischen synonymen Kodons.

Vergleiche der Nukleotidsequenzen mehrerer bisher beschriebener Pseudogene, einschließlich Alpha- und Beta-Globin sowie Immunoglobulin Kappa-Typ variable Domänen-Pseudogene, mit denen von funktionalen Gegenstücken haben gezeigt, dass Pseudogene Mutationen in einer äußerst hohen Rate gleichmäßig über ihre gesamte Länge akkumulieren. Es ist bemerkenswert, dass die evolutive Rate die Rate der Veränderungen zwischen synonymen Kodons, die höchste bekannte Rate bei funktionalen Genen, übersteigt. Da keines der Pseudogene anscheinend funktioniert, unterstützt dieses Ergebnis stark die neutrale Theorie. Darüber hinaus deutet dieses Ergebnis offenbar auf das Vorhandensein von Selektionsdruck gegen Veränderungen zwischen synonymen Kodons in funktionalen Genen hin. Detaillierte Untersuchungen der Kodon-Nutzungsmuster bei Pseudogenen und funktionalen Genen zeigten eine signifikante Korrelation zwischen der Rate der Veränderungen an den Positionen synonymer Kodons und der Stärke der Verzerrung in der Verwendung von Wortcodes. Dies impliziert, dass selbst Veränderungen bei synonymen Kodons nicht völlig frei von Selektionsdruck sind, sondern teilweise eingeschränkt werden, obwohl vermutlich schwach, abhängig vom Grad der Verzerrung in der Verwendung von Wortcodes. Wir haben auch die Ausrichtung zwischen dem Maus-Beta-h3 (Pseudogen) und den Beta-maj-Sequenzen neu untersucht und eine einzigartige Struktur des Beta-h3 gefunden, die im Gesamtverlauf homolog zur Beta-maj-Genfolge ist, jedoch eine lange Deletion (ca. 150 Basenpaare) in der Mitte des Gens enthält.