Molekulare Phylogenie und Divergenzzeiten der Deuterostomier

Die phylogenetischen Beziehungen zwischen Deuterostomiern werden seit vielen Jahren debattiert, und es wurden eine Vielzahl von Hypothesen aufgestellt, die sowohl auf morphologischen als auch auf molekularen Daten basieren. Hier haben wir Sequenzen von 217 nuklear-kodierten Proteinen zusammengestellt, um spezifische Fragen zu ihren Beziehungen und Ursprungszeiten zu adressieren. Wir fanden signifikante Unterstützung für Urochordaten als die nächstverwandten Angehörigen der Vertebraten mit einer Analyse von 59 Proteinen (17.400 Aminosäuren) und schlagen vor, dass die basale Position der Urochordaten, die in früheren molekularen Studien gefunden wurde, das Ergebnis von Attraktionsverzerrungen durch lange Äste gewesen sein könnte. Unsere Ergebnisse unterstützen auch Ambulacraria, die Paarung von Hemichordaten mit Echinodermen (neun Proteine; 2.382 Aminosäuren), und Cyclostomata, die Paarung von Neunaugen mit Schleimaalen (25 Proteine; 6.895 Aminosäuren). Darüber hinaus wurden 325 geteilte Proteine (102.110 Aminosäuren) aus den vollständigen Genomen von sechs Vertebraten und einem Urochordaten für phylogenetische Analysen und Schätzungen der Divergenzzeiten gewonnen. Ein evolutionäres Zeitmaß wurde mithilfe einer lokalen (bayesianischen) molekularen Uhrmethode geschätzt. Wir fanden heraus, dass die meisten Hauptlinien der Deuterostomier vor der kambrischen Explosion von Fossilien (ca. 520 MYA) entstanden sind und dass mehrere Linien vor Perioden globaler Vergletscherung im Präkambrium ihren Ursprung hatten.