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Die Methylierung von CpG-Dinukleotiden in proximalen Promotoren ist oft mit transkriptioneller Stilllegung verbunden. Methylierungsabhängige Repression ist gut etabliert für hypermethylierte CpG-Insel-Promotoren, die durch eine hohe Dichte von CpG-Resten gekennzeichnet sind. Der Effekt der CpG-DNA-Methylierung auf CpG-arme Promotoren ist weniger gut charakterisiert, wahrscheinlich aufgrund des Mangels an geeigneten Assaysystemen, um die Promotoraktivitäten in vitro zu testen. In diesem Bericht beschreiben wir einen neuartigen Luciferase-Reporter-Vektor, pCpGL, der vollständig frei von CpG-Dinukleotiden ist und verwendet werden kann, um den Effekt der Promotor-DNA-Methylierung in Transfektionsassays zu untersuchen. Während ein traditioneller Reporter-Vektor, der eine große Anzahl von Backbone-CpG-Resten enthält, einen CpG-freien Promotor bei Methylierung signifikant suppressiert, wird unser neuer Reporter-Vektor nur aufgrund der Anwesenheit von funktionell wichtigen, methylierenden CpG-Resten repressiert. Der pCpGL-Vektor bietet ein nützliches Werkzeug, um die Auswirkungen der CpG-Methylierung auf CpG-reiche und CpG-arme Promotoren zu untersuchen.
Klug et al. (Sat,) haben diese Frage untersucht.
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