October 1, 2010Open Access
Schnelle Haplotype-Inferenz für Kernfamilien
Key Points
Key points are not available for this paper at this time.
Abstract
Hapi ist ein neuer dynamischer Programmieralgorithmus, der uninformative Zustände und Zustandsübergänge ignoriert, um effizient minimal-rekombinante und maximale Likelihood-Haplotypen zu berechnen. Bei Anwendung auf einen Datensatz mit 103 Familien ist Hapi 3,8 und 320-mal schneller als hochmoderne Algorithmen. Da Hapi sowohl minimal-rekombinante als auch maximale Likelihood-Haplotypen ableitet und auf verwandte Individuen anwendbar ist, sind die abgeleiteten Haplotypen über erweiterte genomische Distanzen hinweg äußerst genau.