Vergleichende Analyse durch unabhängige Kontraste (CAIC): eine Apple Macintosh-Anwendung zur Analyse vergleichender Daten

CAIC ist eine Anwendung für den Apple Macintosh, die die gültige Analyse von vergleichenden (mehrarten) Datensätzen ermöglicht, die kontinuierliche Variablen enthalten. Der Vergleich zwischen Arten ist die häufigste Technik, um Hypothesen darüber zu testen, wie Organismen an ihre Umwelt angepasst sind, aber standardstatistische Tests wie Regression sollten nicht mit Artendaten verwendet werden. Solche Tests setzen die Unabhängigkeit der Datenpunkte voraus, aber verwandte Arten teilen oft Merkmale durch gemeinsame Abstammung statt durch unabhängige Anpassung. CAIC verwendet eine Phylogenie der Arten im Datensatz, um die Varianz zwischen den Arten in unabhängige Vergleiche (technisch, lineare Kontraste) zu unterteilen, wobei jeder Vergleich an einem anderen Knoten in der Phylogenie erfolgt. Es gibt zwei Partitionierungsverfahren – eines, das verwendet wird, wenn alle Variablen kontinuierlich sind, und das andere, wenn eine Variable diskret ist. Die resultierenden Vergleiche können in standardstatistischen Programmen gültig analysiert werden, um Hypothesen über korrelierte Evolutionen zwischen Merkmalen zu testen, Parameter wie allometrische Exponenten zu schätzen und Evolutionsraten zu vergleichen. Frühere Versionen des Pakets wurden bereits weit verbreitet verwendet; diese Version ist einfacher zu handhaben und funktioniert auf einer breiteren Palette von Geräten. Das Paket und das Handbuch sind kostenlos über anonymen FTP oder von den Autoren erhältlich.