ZUSAMMENFASSUNG Neueste technologische Entwicklungen in der räumlichen Transkriptomik ermöglichen es Forschern, die Genexpression von Zellen und ihre räumlichen Standorte auf fast Einzelzellebene zu messen, was detaillierte biologische Einblicke in biologische Prozesse generiert. Spezialisierte Datenbanken für räumliche Transkriptomik sind jedoch selten. Hier präsentieren wir die Spatial TranscriptOmics DataBase (STOmicsDB), eine benutzerfreundliche Datenbank mit Multifunktionen, darunter die Suche nach relevanten Publikationen und Werkzeugen, öffentliche Datensatzvisualisierung, maßgeschneiderte spezialisierte Datenbanken, neues Datenarchiv und Online-Analyse. Die aktuelle Version von STOmicsDB umfasst 141 kuratierte räumliche Transkriptomdatensätze, die 12 Arten abdecken, und beinhaltet 5.618 räumliche Multi-Omik-Publikationen und 674 Werkzeuge. STOmicsDB ist kostenlos zugänglich unter https://db.cngb.org/stomics/.
Xu et al. (Mon,) haben diese Frage untersucht.