Analyse und Bewertung der Vorhersagen des vergleichenden Modellierens in CASP4

Hier beschreiben wir die Ergebnisse unserer Analyse der Vorhersagen des vergleichenden Modellierens, die zur vierten Runde der Kritischen Bewertung der Strukturvorhersage (CASP4) eingereicht wurden. Auf der Grundlage einer numerischen Bewertung der Modelle haben wir deren Fähigkeit bewertet, die allgemeine Faltung korrekt vorherzusagen, die relative Ausrichtung der Domänen in multidomänen Proteinen, die Konformation der Seitenketten, die Schleifenregionen und die biologisch wichtigen Reste der Zielstrukturen. Wir diskutieren auch die Leistung automatischer Vorhersageserver und vergleichen die Ergebnisse von CASP4 mit den in CASP3 erzielten Ergebnissen.