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U6 kleine nukleäre RNA (snRNA) ist ein wesentlicher Faktor beim mRNA-Spleißen. Aufgrund der hohen Erhaltung ihrer Sequenz wurde vorgeschlagen, dass U6 snRNA während der Spleißreaktion katalytisch wirken könnte. Wenn dies der Fall ist, ist es wahrscheinlich, dass U6 snRNA mit den Spleißstellen im Spleißosom interagiert, um die Reaktion zu katalysieren. Wir haben UV-Crosslinking verwendet, um die Interaktionen von U6 snRNA mit den Spleißsubstraten während der Spleißreaktion in Hefe zu analysieren. Es wurden quervernetzte Produkte identifiziert, in denen der zentrale Bereich der U6 snRNA mit dem 5'-Spleißstellenbereich des mRNA-Vorläufers und des Lasso-Intermediats verbunden war. Die Crosslinking-Stellen wurden in einem dieser Produkte genau lokalisiert. Die Ergebnisse deuten auf eine mögliche Basenpaarungsinteraktion zwischen U6 snRNA und der 5'-Spleißstelle des mRNA-Vorläufers hin.
Sawa et al. (Tue,) haben diese Frage untersucht.