Mischmodellierungsansatz für Flusszytometriedaten

Die Flusszytometrie ist zu einer grundlegenden Technik geworden, um fluoreszierende und physikalische Eigenschaften einzelner Zellen in einer suspendierten Mischung zu messen. Diese Daten werden während der Analyse durch einen manuellen oder halbautomatisierten Prozess der Gating-Reduktion verarbeitet. Trotz der Notwendigkeit, Daten für traditionelle Analysen zu maskieren, ist allgemein anerkannt, dass die Variabilität zwischen Analysten die Datensätze beeinflussen kann. Darüber hinaus können Zellen von Interesse unbeabsichtigt vom Gate ausgeschlossen werden, und Beziehungen zwischen gesammelten Variablen können unbemerkt bleiben, weil sie nicht im ursprünglichen Analyseplan enthalten waren. Eine multivariate Nicht-Gating-Technik wurde entwickelt und implementiert, die dasselbe Ziel wie das traditionelle Gating erreichte, während viele Schwächen beseitigt wurden. Das Verfahren wurde gegen das traditionelle Gating validiert für die Analyse von zirkulierenden B-Zellen in normalen Spendern (n = 20) und Personen mit systemischem lupus erythematodes (n = 42). Die Methode spiegelte die Beziehungen im Datensatz wider und bot eine automatisierte und objektive Bewertung der Daten. Flusszytometrie-Analysen sind für automatisierte analytische Techniken geeignet, die nicht auf diskreten, vom Bediener erzeugten Gates basieren. Solche alternativen Ansätze können Subjektivität in der Datenanalyse beseitigen, die Effizienz verbessern und letztendlich den Aufbau großer bioinformatischer Datensysteme für komplexere Ansätze zur Hypothesentestung ermöglichen.